Egy gyógyszer vagy vakcina életútja normális körülmények között könnyen meghaladhatja a 10 évet is, amíg a felfedezéstől a széles körű használatig eljutunk. A rengeteg tesztelést, ellenőrzést és klinikai vizsgálatot igénylő procedúrát azonban a koronavírus okozta rendkívüli helyzet miatt mindenhol igyekeznek a lehető legrövidebbre szorítani. Ennek a küzdelemnek lehet egy hasznos eleme a nemrégiben indult Epitopes.world platform.

MI-vel hidalják át a hiányt

A kezdeményezés mögött igen széles repertoárral bíró szakértői csapat áll. A Harvard és az Université de Montréal kutatói között találunk gépi tanulásban, immunbiológiában és bioinformatikában jártas kutatókat. A mesterséges intelligenciára épülő, interaktív platform a CAMAP-nak hívott algoritmus segítségével képes olyan előrejelzéseket készíteni, ami segítheti az ellenszer hatékonyabb megtalálásában a világ számos pontján dolgozó kutatói csapatokat.

A CAMAP-ot eredetileg a rákkutatás előmozdítására dolgozta ki a mostani projektet vezető Dr. Tariq Daouda, ám úgy tűnik, a kód alkalmas lehet fegyvernek a koronavírus elleni harcban is. Az algoritmus feladata az immunrendszerekben fellelhető mintázatok kiszúrása, ami komoly segítséget jelent a vírus gyenge pontjainak felfedezésében.

Az ellenszeren dolgozó csoportok feladatát nagyon megnehezíti, hogy nincs elegendő "alapanyag" a vakcina kifejlesztéséhez elengedhetetlen tesztekhez, alapvető kutatási munkához. A Covid-19-cel megfertőződött egyéneknél ugyanis lecsökken az immunsejtek száma, ami megnehezíti, hogy elegendő fertőzött sejt kerüljön a laboratóriumokba - a kutatócsapatok tulajdonképpen egymással versenyeznek ezekért a fontos sejtekért.

Az Epitopes.world rendszere ugyan nem szintetizálja az oltóanyag-jelölteket a laborok helyett, de előrejelzései felhasználhatók arra, hogy a biológusok a lehető legígéretesebb célpontokon végezzenek teszteket.

Megfelelő epitópot keresnek

Az oldal nevét is adó epitópok az antigén-molekuláknak, jelen esetben a koronavírusnak az a része, amelyhez az antitest kötődik abból a célból, hogy elpusztítsa. Az előzetes tanítással felturbózott CAMAP-modell 1,5 millió lehetséges epitóp és ezek metaadatainak adatkészletére támaszkodik.

Az Epitopes.world segítségével vizualizációs anyagok is készíthetők, amelyek lehetővé teszik a kutatók számára az eredmények ábrázolását és felhasználását további kutatásokhoz. A szabadon felhasználható rendszert, amelynek API-ja is elérhető, Daouda csapata új eszközök és funkciók hozzáadásával igyekszik fejleszteni a közeljövőben.